Ортомолекулярната медицина използва вещества, които по напълно естествен път попадат в човешкото тяло - чрез храната или просто защото се намират по начало в нашия организъм.
Думата „ортомолекулярност” е с гръцко-латински произход - от гръцкото ортос /правилно, хубаво, добро/ и латинското молекулус /най-малка частица на веществата/.Така се получава обозначението на нов клон на медицината.
Ортомолекулярната медицина използва жизненоважни вещества, най-вече витамини и минерали. Нашият организъм най-често не е в състояние да си ги синтезира самостоятелно. „Ортомолекулите" нормално присъстват в човешкия организъм, в растенията и в животните. Това са витамините, минералите, аминокиселините, фосфолипидите, мастните киселини и още ред други биологично активни вещества.